金口河区位于四川盆地与川西高原过渡地带的小凉山区，群山耸峙、层峦叠嶂，为典型的山地地貌。境内拥有丰富的矿产、水文和动植物资源。

区内已发现的矿产有磷、硅、铁、铜、铅锌、锰、脉石英、水晶、石灰岩、硅化白云岩、腐殖土及伴生矿产银、碘等14种。

区境内主要有过境干流大渡河，一级支流小河、金口河，二级支流野牛河、河水河以及少量的高山湖泊。

区内植物种类达2000余种，其中种子植物130余科1300余种，常见的林木有30余科100余种。经济林木有树脂植物、纤维植物、芳香植物、虫胶植物等。

区内动物区系复杂，种类丰富，古老、珍稀、濒危、渐危物种多，是天然的动物种子基因库。有野生动物200多种，其中兽类30余种，鸟类145种，爬行类13种，两栖类12种，昆虫类300多种，鱼类6种；珍稀特产有50余种，列入国家重点保护Ⅰ、Ⅱ级的有20余种，有大熊猫、扭角羚、四川山鹧鸪、林麝、红腹角雉、金雕、小熊猫、猕猴、黑熊、穿山甲、大鲵、枯叶蝶等，对研究世界生物区系具有重要的地位和保护意义。